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企业所得税在哪个系统申报，个税专项扣除填写申报方式选哪个？
个税申报有两种方式，一种是通过扣缴义务人申报，另一种是综合所得年度自行申报。
其中，通过扣缴义务人申报就是在扣缴单位办理扣除。员工可以填写好纸质表格后，提交给财务或人力资源部门，也可以在APP上填写好相关信息之后直接推送给扣缴单位。
综合所得年度自行申报就是个人直接向税务机关申报。可以下载APP或者登陆网站完成注册，然后按照系统提示操作填写、报送。
如果有任职单位的，可以选第一种，单位每月进行申报。如果是个体户类型的，可以选第二种。
不管选择哪一种报送方式，数据在两端都可以看到 ，单位也可以下载个人填写的专项附加扣除信息进行税前扣除，如果两者出现信息不对等的情况，那么还是以个人提交的为主。
【法律依据】
《个人所得税法》第二条，下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：
（一）工资、薪金所得；
（二）劳务报酬所得；
（三）稿酬所得；
（四）特许权使用费所得；
（五）经营所得；
（六）利息、股息、红利所得；
（七）财产租赁所得；
（八）财产转让所得；
（九）偶然所得。居民个人取得前款第一项至第四项所得（以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。
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